Постановлением Правительства Российской Федерации от 27 октября 2008 г. № 796 учреждены эмблема и флаг Федерального агентства морского и речного транспорта,а также вымпел руководителя Агентства

Герб Федерального агентства морского и речного транспорта

Флаг Федерального агентства морского и речного транспорта

Вымпел руководителя Федерального агентства морского и речного транспорта